不过大魏朝开国太祖灭佛，却是也并没能灭尽天下之佛，不然眼下江湖上的顶尖大派中，就不会还有佛门四宗的存在了。
之所以如此，是因为佛门中也有些有志之士，认识到了当时的佛门已是鱼龙蛇杂，混进了许多为非作歹，非是真心信佛之辈，所以也有志铲除自身上的毒瘤。再加上当时天下各路义军四起，大梁已是大厦将倾，大势已去。
因此佛门也得为未来考虑，做些打算，所以当时大魏朝崛起时，也有些佛门高手以及宗门投效，帮助大魏定鼎天下。大魏朝开国后，这些帮助过大魏的佛教宗门便也是有功之士，自然不好一起铲除。
而且当时的佛门宗派中，也有些是真正的有道之士，就是自家念佛修行求超脱，并没有干过假佛门之名而为非作歹之事，这些也需要甄别，不能一杆子全部打死。
所以大魏朝开国的太祖灭佛，只是灭除了那些佛门毒瘤以及死心拥护大梁的那些佛教宗门，还是留下了几家真心吃斋念佛、行善积德以及慈悲为怀的。
但经过梁末的天下大乱，尤其各路义军、反王都是打出的“灭佛”口号，所以在梁末战乱的那几十年间，天下的寺庙便已是大半遭了战火荼毒被毁，许多僧人和尚也被杀了不少。再等大魏统一天下，定鼎立国后，又开始了由朝廷发起的正式“灭佛”运动。所以连着这两波过去，佛门势力也是大损。
原本在大梁朝佛门势力最鼎盛的时候，那时的佛门可是有十家宗派传承。而到现在，只剩下了佛门四宗。虽然时至今日，也还有些其他六宗的余孽未被消灭干净，但已是难在中原活动。大魏朝廷所承认的，也只有现在的这佛门四宗，剩下的全部被打为“邪教”，是需要被铲除消灭的对象。
甚至据说当时的大魏太祖还跟佛门有过约定，说是只要大魏朝存在一日，佛门便不许有新兴的教派出现。若有，不管是正是邪，教义如何，也都是一律被打为邪教，同样要被消灭，这就在很大程度上制约了佛门的发展与重新兴盛。而且便是现在这四家宗门的传法，也受到了很大约束，不能任意传法与建造寺庙。
不过大魏开国三百年承平下来，现在的大魏朝廷对这佛门四宗传法的约束已是早不如开国之初时那么严格。民间信佛者，也是有日益增多之势。
当然，跟大梁朝时期的佛门最鼎盛阶段还是远远不能相比。而且当初的太祖灭佛，被灭去的那六家佛教宗门也是当时势力最为庞大的六家，剩下的这四宗在当时都是排名靠后的。另外本身的教义也都倾向于清修与苦修路数，不是太讲求肆意传法，发展信众。
而被灭的那六家宗门中，有几家更是大梁朝的死忠拥护者，十分坚定地一心支持大梁皇室的统治，认为只有在大梁朝的统治下，才能实现他们地上佛国的追求与夙愿。
这几家佛教宗门当时既势力庞大，派中也高手众多。所以尽管当时天下烽烟四起，大梁朝大势已去，他们也难以挽回这将倾的大厦，抵不住天下群雄并起，但却是拼死保护了大梁皇室当时的一位皇太孙逃走，并逃进了西南边陲的十万大山中隐藏踪迹。
大魏朝立国后，虽然也有派兵追杀剿灭，但因为有那几家佛教宗门的高手相护，再加上十万大山道路险阻、地势险要、烟障横行，而且实在是太过广大，因此竟是没能剿灭杀死那个大梁朝的余孽。